Come ti ho detto non è consigliabile farlo da dentro windows perchè cambiando la lettera non vengono poi cambiati i collegamenti alle unità sul file di registro, quindi si rischia di avere un bel casino...
Se vuoi provare però, previo backup (se puoi) di tutti i dati che non vuoi perdere (che comunque è cosa da fare perchè può succedere qualcosa che te li cancella e non è bene...), puoi provare a cambiare il nome di C: in E: o altro.... i dati che non vuoi perdere non sarano toccati
.....cosi C:\ rimane una lettera libera e può essere usata come percorso di default per il sistema operativo che procederai a reinstallare nell'altra partizione
Una situazione del genere...
Dati che non vuoi perdere = C: ------> passaggio alla lettera E:
Dati di sistema = D: da riformattare.....
Situazione nuova
Sistema : D:\
Dati : E:\
---> Formattazione di D:\ e distruzione della partizione... E:\ non viene toccato...
---> Creazione di una nuova partizione per il sistema operativo ---> viene proposto automaticamente C:\
-----> installazione del sistema operativo su C:\, i dati sull'altra partizione non vengono toccati...
Ripeto...fai un backup perchè l'operazione non è esente da rischi, però teoricamente dovrebbe funzionare.