Ciao Pompeo, grazie per la tua segnalazione che potrà essere utile ad altri utenti...
La partizione nascosta di Windows 10 non va mai toccata, al sistema serve poter avere uno spazio sul quale creare il file allocation table ovvero la tabella di allocazione file, se tu gliela togli allora è normale che il sistema non parta più e va ripristinato.